{"id":2491,"date":"2020-06-04T10:35:13","date_gmt":"2020-06-04T08:35:13","guid":{"rendered":"http:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/?p=2491"},"modified":"2020-06-04T10:35:15","modified_gmt":"2020-06-04T08:35:15","slug":"uczenie-glebokie-w-badaniu-plastycznosci-polaczen-korowych-ssakow-naczelnych-po-uszkodzeniach-pierwszorzedowej-kory-wzrokowej","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/2020\/06\/04\/uczenie-glebokie-w-badaniu-plastycznosci-polaczen-korowych-ssakow-naczelnych-po-uszkodzeniach-pierwszorzedowej-kory-wzrokowej\/","title":{"rendered":"Uczenie g\u0142\u0119bokie w badaniu plastyczno\u015bci po\u0142\u0105cze\u0144 korowych ssak\u00f3w naczelnych po uszkodzeniach pierwszorz\u0119dowej kory wzrokowej"},"content":{"rendered":"\n<p>Promotor: dr Piotr Majka \/ prof. dr hab. Daniel W\u00f3jcik<\/p>\n\n\n\n<p>Pracownia Neuroinformatyki<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-embed is-type-link is-provider-laboratory-of-neuroinformatics\"><div class=\"wp-block-embed__wrapper\">\n<a href=\"https:\/\/neuroinflab.wordpress.com\/\">Laboratory of Neuroinformatics<\/a>\n<\/div><\/figure>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">Opis<\/h3>\n\n\n\n<p>Projekt ma charakter obliczeniowo-analityczny a jego g\u0142\u00f3wnym celem jest zbadanie reorganizacji uk\u0142adu wzrokowego po uszkodzeniach pierwszorz\u0119dowej kory wzrokowej. Uszkodzenia tego rodzaju s\u0105 cz\u0119st\u0105 konsekwencj\u0105 udar\u00f3w m\u00f3zgu, jak r\u00f3wnie\u017c jednym z&nbsp;najcz\u0119stszych rodzaj\u00f3w oko\u0142oporodowego uszkodzenia m\u00f3zgu.<\/p>\n\n\n\n<p>W projekcie zostanie zastosowany szereg nowatorskich metod analizy obrazu oraz narz\u0119dzi neuroinformatycznych (Instytut Nenckiego) oraz metod wyznakowywania po\u0142\u0105cze\u0144 (realizowanych przez partnera w Monash University w Australii) w celu zbadania plastyczno\u015bci po\u0142\u0105cze\u0144 korowych oraz populacji r\u00f3\u017cnych typ\u00f3w neuron\u00f3w po cz\u0119\u015bciowym usuni\u0119ciu pierwszorz\u0119dowego obszaru wzrokowego we wczesnym okresie poporodowym oraz w doros\u0142o\u015bci.<\/p>\n\n\n\n<p>W badaniach zostan\u0105 u\u017cyte dane z ssak\u00f3w naczelnych (ma\u0142pki marmozety zwyczajnej), kt\u00f3rej uk\u0142ad wzrokowy dobrze odzwierciedla ludzki. Marmozety s\u0105 cennym modelem zwierz\u0119cym pozwalaj\u0105cym na g\u0142\u0119bsze zrozumienie rozwoju m\u00f3zgu oraz jego plastyczno\u015bci dzi\u0119ki szybkiemu dorastaniu osobnik\u00f3w tego gatunku w por\u00f3wnaniu z&nbsp;innymi ssakami naczelnymi.<\/p>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">Cel projektu<\/h3>\n\n\n\n<p>W pierwszej kolejno\u015bci zadania doktoranta b\u0119d\u0105 obejmowa\u0142y opracowanie nowatorskich metod wysokoprzepustowej ilo\u015bciowej analizy obraz\u00f3w mikroskopowych opartych na uczeniu maszynowym, m.in. morfologii wyznakowanych neuron\u00f3w, detekcji wi\u0105zek akson\u00f3w, jak r\u00f3wnie\u017c metod dopasowywania obraz\u00f3w. Metody te zostan\u0105 nast\u0119pnie wykorzystane przez doktoranta do zrealizowania dw\u00f3ch zada\u0144 badawczych:<\/p>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Badanie plastyczno\u015bci po\u0142\u0105cze\u0144 szlak\u00f3w wzrokowych po lezjach pierwszorz\u0119dowej kory wzrokowej u osobnik\u00f3w m\u0142odych oraz doros\u0142ych.<\/li><li>Badanie zmian w liczebno\u015bci i typie neuron\u00f3w po oko\u0142oporodowych lezjach pierwszorz\u0119dowej kory wzrokowej oraz w doros\u0142o\u015bci.<\/li><\/ol>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">Wymagania<\/h3>\n\n\n\n<ol class=\"wp-block-list\"><li>Silna motywacja do pracy naukowej.<\/li><li>Tytu\u0142 magistra z zakresu nauk \u015bcis\u0142ych (np. fizyka, matematyka, biologia, biofizyka lub kierunki pokrewne).<\/li><li>Znajomo\u015b\u0107 j\u0119zyka Python oraz pow\u0142oki systemu Linux. Znajomo\u015b\u0107 j\u0119zyka C++ oraz do\u015bwiadczenie w&nbsp;korzystaniu z infrastruktury HPC (oblicze\u0144 o&nbsp;wysokiej wydajno\u015bci) b\u0119d\u0105 dodatkowymi atutami.<\/li><li>Co najmniej praktyczna znajomo\u015b\u0107 metod numerycznych oraz metod analizy obraz\u00f3w.<\/li><li>Bieg\u0142a znajomo\u015b\u0107 j\u0119zyka angielskiego w mowie i pi\u015bmie umo\u017cliwiaj\u0105ca wsp\u00f3\u0142prac\u0119 z&nbsp;partnerami zagranicznymi.<\/li><\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Promotor: dr Piotr Majka \/ prof. dr hab. Daniel W\u00f3jcik Pracownia Neuroinformatyki Opis Projekt ma charakter obliczeniowo-analityczny a jego g\u0142\u00f3wnym celem jest zbadanie reorganizacji uk\u0142adu wzrokowego po uszkodzeniach pierwszorz\u0119dowej kory wzrokowej. Uszkodzenia tego rodzaju s\u0105 cz\u0119st\u0105 konsekwencj\u0105 udar\u00f3w m\u00f3zgu, jak<span class=\"excerpt-hellip\"> [\u2026]<\/span><\/p>\n","protected":false},"author":9,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"om_disable_all_campaigns":false,"_monsterinsights_skip_tracking":false,"_monsterinsights_sitenote_active":false,"_monsterinsights_sitenote_note":"","_monsterinsights_sitenote_category":0,"footnotes":""},"categories":[11],"tags":[],"class_list":["post-2491","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-job-offers"],"aioseo_notices":[],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2491","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/9"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2491"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2491\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":2492,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/2491\/revisions\/2492"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2491"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=2491"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/zfbweb.zfb.fuw.edu.pl\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=2491"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}